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基因组所发布表不雅基因组数据库MethBank 30

时间:2017-11-05 15:36  来源:未知 发表日期:2017-11-05   点击:

  千亿国际娱乐手机官网Methbank 3.0整合了大量DNA甲基化数据。做为表不雅润色的主要构成部门,DNA甲基化正在人类疾病取衰老、动物胚胎发育以及动物发展发育过程都起主要感化。MethBank 3.0供给了4577个健康人外周血样本的450K芯片数据,并编审成34个分歧春秋组的参比甲基化组(consensus reference methylomes,CRMs);供给分歧春秋组健康人基因组胞嘧啶位点甲基化程度的分布范畴,整合5个主要经济做物(水稻、大豆、木薯、菜豆和番茄)分歧发育阶段多个组织的336个单碱基精度甲基化组(single-base resolution methylomes,STMs)和两个模式动物(斑马鱼和小鼠)的配子取晚期胚胎发育的18个单碱基精度甲基化组。比拟于之前版本,MethBank 3.0有愈加细致、系统的正文取阐发,识别了692个春秋相关甲基化位点、2371个取春秋无关的位点、304886个差别甲基化启动子(DMPs)、53680个春秋的甲基化位点(age-specific DMCs)、1716个春秋的甲基化区域(age-specific DMRs)以及693825个甲基化的CpG岛。此外,Methbank 3.0供给两个阐发东西(Age Predictor和IDMP)别离用于预测人的甲基化春秋和识别差别甲基化启动子。

  Methbank 3.0配备敌对的浏览、查询取可视化功能,用户可通过基因ID/ymbol、基因组等检索甲基化消息,浏览指定差别甲基化启动子或高甲基化CpG岛,通过ftp下载所有相关正文数据取阐发成果。

  研究工做获得了中科院计谋性先导科技专项、中科院国际合做打算、国度科技攻关打算、国度高手艺研究成长打算(863打算)、中科院百人打算等的赞帮。

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